树形结构网站如同一颗枝繁叶茂的树木，由主干、主分支、子分支、叶子四部分组成。主干相当于网站的主页，主分支相当于二级栏目，子分支相当于三级、四级栏目(某些简单的企业网站可能会省略三级、四级栏目)，叶子相当于每个栏目的子页面或者最终页面，而所有的这些都是决定关键词排名的因素。
树状结构的示意图如上图所示，如果单看图有些抽象的话，具体到网站实例中对应的URL如下：
主干：www.admin5.com
主分支：www.admin5.com/article/
子分支：www.admin5.com/article/20160621/
叶子：www.admin5.com/article/20160621/670597.shtml
不难理解，670597.shtml就是20160621栏目的子页面(编者注：子页面不同于子栏目，如/20160621/是/article/的子栏目，而670597.shtml是/20160621/栏目的子页面，也是/article/栏目的最终页面，请读者加以区分)
树状结构网站优势：
大型网站多采用树状结构，因为大型网站本身权重就已经很高，其二级甚至三级栏目的权重会高于一些新站首页的权重，因此可以利用二级栏目、三级栏目这类的“分支”，做其他相关关键词的排名，而且每个新增栏目也会在搜索引擎快速获得比较高的权重，这一点是平行结构网站所欠缺的。
树状结构网站劣势：
需要对每个栏目都进行维护，内容建设方面也需要经常更新原创文章，并且维护困难，不利于做单一的关键词，换言之就是不利于集中单个关键词的权重。
开源程序：
dedecms、phpcms等，都是开源的树状结构网站管理系统。
扁平结构型网站的示意图如上图所示：以网站首页为起点，延伸出的页面都是以网站主域名为基础的页面或栏目，同样网站实例以对应的URL为例说明。